По прошению попечителя Армянских церквей г. Москвы, представителя знаменитого рода Лазаревых – Минаса Лазаревича Лазарева, Указом Московского Губернского Правления от 21 апреля 1805 г. был отведен участок земли площадью 2,22 га под Армянское кладбище.

До этого Армянское кладбище находилось на Большой Грузинской улице в районе дома № 20. На территории Пресненского Армянского кладбища (так оно тогда называлось) в начале XVIII века была построена первая армянская церковь в Москве (1746 г.) Успения Пресвятой Богородицы.

Пресненское кладбище и церковь были снесены в советское время в 1930 году.

В этом же году была снесена армянская церковь «Сурб Хач» (построена в 1779 г.), которая находилась в Армянском переулке (напротив здания Армянского посольства).

На выделенном участке армянского кладбища в 1815 году было закончено строительство церкви «Сурб Арутюн» (начало строительства – 1808 год).

В 1859 году на средства московского купца 3-й гильдии И.Гаспаряна (Касперова) вокруг кладбища был построен каменный забор из красного кирпича. Высота забора – 4,26 м, длина по периметру – 541 м (площадь кладбища уменьшилась до 1.83 га). В Москве это первая каменная ограда вокруг кладбища. Обычно московские кладбища ограждались деревянными заборами.

В 1903 году владельцами «Банкирского дома братьев Джамгаровых» в северной части территории кладбища был построен поминальный дом.

В северо-восточной части кладбища находятся три часовни, построенные крупным банкиром И.С.Анановым. Переулок в Москве, где находились его владения, назывался Анановским (сейчас Ананьевский). В средней часовне захоронены Иван Степанович Ананов, его зять – Кананов Георгий Ильич (муж дочери Варвары) – в правой часовне, а в левой часовне – его другой зять (муж дочери Глены) – адвокат Миансаров Аршак Месропович. На 6-м участке захоронен один из известных общественных деятелей московских армян того времени Соломон Артемьевич Тер-Гукасов, родной брат генерал-лейтенанта Аршака Тер-Гукасова.

Построенная церковь «Сурб Арутюн» («Св. Воскресение») позднее стала усыпальницей для членов семьи Лазаревых. На двух уровнях под полом церкви захоронены 23 представителя фамилии Лазаревых.

Справа от входа на кладбище, а также в восточной части – находятся братские могилы воинов Великой Отечественной Войны. Установлен обелиск.

Справа от входа в церковь находится памятник (хачкар), посвященный всем армянам, погибшим в период Геноцида в Турции, Сумгаите, жертвам сталинских репрессий.

Слева от входа на кладбище в декоративной башне ограды в 1998 году сооружен памятник «Оставленным могилам». Это памятник, куда могут прийти те армяне-беженцы, которые оставили могилы своих родных и близких, и возложить цветы в память о них.

Армянское кладбище имеет прямоугольную форму. Разделено аллеями и дорожками. Делится на 7 участков различной величины. По углам установлены номера участков.

На Армянском кладбище имеется более 10000 захоронений (по 1991 год). Самая старая могила из сохранившихся – Аракеловой Елизаветы Ивановны (1799 – 1818).

Необходимо отметить, что до революции 1917 года фамилии усопших на могилах писали как на армянском, так и на русском языке. В советское время и сейчас пишут на русском языке.

Армянское кладбище и русское Ваганьковское кладбище разделено улицей им. Сергея Макеева.

Русское Ваганьковское кладбище занимает более 500 га. Во время чумы в Москве (1771 год) было открыто много кладбищ, среди которых было и Ваганьковское.

Местность за рекой Пресня называлось Ваганьково, потому и кладбище назвали Ваганьковским.

До 1869 года кладбище армянских захоронений называлось просто Армянским кладбищем. Затем его стали называть Армянским Ваганьковским кладбищем, как бы отделяя его от другого армянского кладбища (Пресненского).

Вначале на Армянском Ваганьковском кладбище хоронили строго по вероисповеданию (армян-купцов, ремесленников). В конце XIX века стали погребать усопших различных вероисповеданий.

В настоящее время Армянское Ваганьковское кладбище является филиалом Русского Ваганьковского кладбища. Единая администрация находится на территории Русского Ваганьковского кладбища.

На Армянском кладбище захоронены известные граждане – деятели XVIII–XIX веков и дореволюционного времени – Лорис-Меликов Андреас Атанасович, князь Аргутинский-Долгорукий Николай Андреевич, Лазарев Лазарь Эммануилович, Лианозов Георгий Мартынович, Джамгаров Исаак Исаакович, Джаншиев Григорий Аветович; писатели, поэты – Смбат Семенович Шах-Азиз, Мариэтта Сергеевна Шагинян, Василий Григорьевич Янчевецкий (Ян), Андрей Платонович Платонов, Мария Давыдовна Чернышева (Мария Марич); артисты, музыканты – Борис Осипович Сибор, Андрей Аванесович Бабаев, Микаэл Левонович Таривердиев, Михаил Иванович Тэриан, Павел Герасимович Лисициан, Никита Семенович Морозов; кинорежиссеры – Амо Иванович Бек-Назаров, Лев Константинович Атаманов; академики Ваче Иванович Исагулянц, Левон Оганесович Бадалян, Николай Александрович Майсурян, Тигран Сергеевич Хачатуров, Михаил Христофорович Чайлахян; известный лингвист, член-корреспондент АН СССР Рубен Иванович Аванесов; шахматист Тигран Вартанович Петросян; Баланина М.Н. – мать известного конструктора космических кораблей Сергея Павловича Королева, создателя советской космонавтики и многие другие.